杜特尔特第二年任期内将面临哪些挑战？美联社24日给出的答案是：打击与IS有关的激进组织、禁毒战争和南海问题。相关报道说，在南部负隅顽抗的武装分子中，有的来自外国，而根除南部的极端组织是杜特尔特5位前任都未能完成的任务。美国《时代》周刊网站评论说，杜特尔特的最新言论以及菲政府军未能在承诺时间内收复马拉维，加剧了外界对菲律宾解决马拉维危机能力的质疑。
 
新加坡、印度尼西亚等国官员已表达担忧，称棉兰老岛可能成为IS在东南亚的新据点。有马尼拉民众告诉《环球时报》记者，杜特尔特过去一年在外交上做出很大调整，但还要兼顾民生，不能只盯着扫毒，只有落实他的团队提出的“杜特尔特经济学”，才能让底层百姓更多感受到外交内政调整带来的积极变化。