美军向叙利亚发射导弹被媒体报道后，日本官房长官菅义伟在首相官邸回答记者提问，表示“现在开始将听取说明”。对于是否有来自美方的说明，他仅回答说“不知道”。
 
日本防卫省相关人士指出“若使用了50多枚巡航导弹实施打击，那此事就很重大”，“虽然不清楚美方是否会要求自卫队发挥某种作用，但需要慎重关注情况”。一名政府消息人士难掩惊讶地表示，“看了电视觉得很震惊”。
 
联合执政的日本公明党干事长井上义久在记者会上表示：“我认为使用化学武器基本属实。查明真相十分重要。必须充分把握相关各国的应对举措。”
 
共同社4月7日报道称，美俄关系可能出现恶化，将密切关注作为叙利亚阿萨德政府后盾的俄罗斯如何应对。此外，日本政府也在关注美中首脑会谈的走向。